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孕酮与干扰素-τ对体外培养的牛子宫内膜细胞基因组表达谱的影响
中文名称: 孕酮与干扰素-τ对体外培养的牛子宫内膜细胞基因组表达谱的影响
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论文编号: 4143160收藏本论文】【我的收藏】【我要投稿
英文名称: Effects of Genome Gene Expression Profiling of Progesterone and Interferon-tau on Bovine Endometrial Cell Cultured in Vitro
学位类型: 博士毕业论文
作者: 涉及隐私,隐去***  作者本人请参看权力声明>>
导师: 涉及隐私,隐去***
毕业学校: 涉及隐私,隐去***
专业: 畜牧生物工程
毕业年份: 涉及隐私,隐去***
关键字: 干扰素一τ 孕酮 妊娠识别 胚胎植入 基因组表达谱 差异表达
简介目录: 点击此处 免费索取本论文简介和目录>>
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论文摘要: 妊娠识别过程是决定妊娠是否成功的一个关键环节,其中约有25%的胚胎死亡发生在该期.牛妊娠识别过程涉及到复杂的分子信号调控机制,包括由早期孕体产生某些信号物质,作用于子宫内膜细胞发出相应(略)制黄体的溶解(略)排斥,使母体发生一系列的孕向发育.由胚胎滋养层单核细胞合成分泌干扰素-τ(bIFN-τ)和母体妊娠激素孕酮(P)共同作用于子宫内膜,引起子宫内膜上与妊娠识别和胚胎植入相关基因表达的变化,同时信号也完成了从bIFN-τ主导到孕酮主导的转换. 本研究采用Agilent牛基因组表达谱芯片检测了体外培养的牛(略)IFN-τ、P以及bIFN-T+P作用下基因组层次上的基因表达谱变化.主要研究结果有: ⒈成功构建了牛子宫内膜细胞体外培养模型.在100 IU/mL Pen+ 100μg/mL Str+2μmol/mL Glu+DMEM-Ham(略)+20%FBS的培养体系中,牛子宫内膜细胞能正常生长.原代和传代细胞类型主要为来自子宫内膜上皮的上皮细胞和来自子宫内膜基质的成纤维细胞. ⒉差异表达和聚类结果显示:在孕酮组vs(略)表达的基因有1401个,其中上调和下调...
During the establishment of pregn(omitted)w, interferon-tau (bIFN-τ) as the identification signal of conceptus and progeste(omitted)s the maternal pregnancy hormone joint act in endometrium, which caused the changes of genes be (omitted) pregnancy recognition and embryo implantation in endometrium, meanwhile (omitted) accomplished from bIFN-τleading to P dominant. In this study, we used the Agilent bovine genome commercial microarray to examine the di(omitted) gene expression profiling of in endomet...
目录:
英文缩写第8-9页
样本符号对照表第9-10页
中文摘要第10-12页
ABSTRACT第12-14页
第1章 文献综述第15-33页
  ·研究背景第15-16页
  ·干扰素-τ及其在妊娠识别中的调控研究进展第16-21页
    ·干扰素-τ的结构与同源性第16-17页
    ·干扰素-τ的表达调控第17页
    ·干扰素-τ在妊娠识别中的作用第17-21页
  ·孕酮及其在胚胎植入中的调控研究进展第21-23页
    ·胚胎植入过程第21-22页
    ·孕酮及其受体在胚胎植入过程中的作用第22-23页
  ·基因芯片技术及其在牛生物学上的应用研究进展第23-32页
    ·基因芯片技术概述第23-26页
    ·基因芯片技术在牛生物学研究中的应用第26-32页
  ·研究的目的意义及主要内容第32-33页
    ·研究的目的意义第32页
    ·研究的主要内容第32-33页
第2章 牛子宫内膜细胞体外培养模型的建立第33-41页
  ·前言第33页
  ·材料与方法第33-37页
    ·试验材料第33页
    ·试验中主要仪器和试剂第33-35页
    ·实验方法第35-37页
  ·实验结果分析第37-39页
    ·牛子宫内膜细胞原代培养第37-38页
    ·牛子宫内膜细胞传代培养第38页
    ·牛子宫内膜细胞鉴定第38-39页
  ·讨论第39-41页
    ·牛子宫内膜细胞原代培养第39-40页
    ·牛子宫内膜细胞传代培养与胰酶消化第40页
    ·牛子宫内膜细胞免疫荧光鉴定第40-41页
第3章 利用基因组表达谱芯片研究孕酮与干扰素-τ影响牛子宫内膜基因的表达谱第41-57页
  ·前言第41页
  ·材料与方法第41-51页
    ·试验材料第41页
    ·试验中主要仪器和试剂第41-44页
    ·实验方法第44-51页
  ·结果分析第51-54页
    ·Total RNA的甲醛变性琼脂糖电泳结果第51页
    ·RNA Pool的毛细管电泳第51-52页
    ·芯片扫描结果第52-54页
    ·标准化结果第54页
  ·讨论第54-57页
    ·实验设计第54-55页
    ·芯片类型的选择第55页
    ·实验数据的标准化处理第55-56页
    ·缺失值估计第56-57页
第4章 基因表达差异分析和基因聚类分析第57-66页
  ·前言第57-58页
  ·分析策略及方法第58-59页
    ·批量Blast数据库构建第58页
    ·差异表达基因分析第58-59页
    ·差异基因聚类分析第59页
  ·结果分析第59-65页
    ·批量Blast数据库构建第59页
    ·差异表达基因分析第59-61页
    ·差异基因聚类分析第61-65页
  ·讨论第65-66页
第5章 芯片数据的生物学功能挖掘——显著性功能及信号分析第66-101页
  ·前言第66-67页
  ·分析策略及方法第67-69页
    ·Gene Ontology(GO)富集分析第67-68页
    ·Pathway富集分析第68页
    ·基因间共表达网络构建(Co-Expression-Network)第68-69页
  ·结果分析第69-91页
    ·Gene Ontology(GO)富集分析第69-82页
    ·Pathway富集分析第82-88页
    ·基因间共表达网络构建(Co-Expression-Network)第88-91页
  ·讨论第91-101页
    ·Gene Ontology(GO)富集分析第91-93页
    ·Pathway富集分析第93-96页
    ·基于基因间共表达网络的发现第96-101页
第6章 表达谱数据的可靠性验证第101-108页
  ·前言第101页
  ·材料与方法第101-104页
    ·芯片实验自身的质控第101页
    ·荧光定量PCR验证第101-104页
      ·引物设计与合成第101-102页
      ·TotalRNA提取和质检第102页
      ·cDNA的合成第102-103页
      ·荧光定量PCR第103页
      ·数据统计与分析第103-104页
  ·结果与分析第104-107页
    ·芯片实验的变异系数第104页
    ·荧光定量PCR与芯片检测结果的相关性第104-107页
  ·讨论第107-108页
    ·芯片质控评价第107页
    ·荧光定量PCR与芯片检测结果的相关性第107-108页
第7章 结论与展望第108-111页
  ·结论第108-109页
  ·研究展望第109-111页
参考文献第111-121页
附录第121-129页
  ·孕酮组vs对照组中差异基因的共表达网络图第121-125页
  ·孕酮+干扰素-τ组vs对照组中差异基因的共表达网络图第125-129页
致谢第129-130页
攻读学位期间发表的学术论文第130页
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