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低温胁迫下柑橘正反向差减cDNA文库的构建及生物信息学分析
中文名称: 低温胁迫下柑橘正反向差减cDNA文库的构建及生物信息学分析
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论文编号: 4143069收藏本论文】【我的收藏】【我要投稿
英文名称: Construction of Forward and Reverse Subtracted cDNA Libraries from the Leaves of Poncirus Trifoliata (L.) Raf. under Low-temperature Stress and Bioinformatics Analysis
学位类型: 硕士毕业论文
作者: 涉及隐私,隐去***  作者本人请参看权力声明>>
导师: 涉及隐私,隐去***
毕业学校: 涉及隐私,隐去***
专业: 生物化学与分子生物学
毕业年份: 涉及隐私,隐去***
关键字: 低温驯化 抑制性消减杂交 EST序列 生物信息学分析
简介目录: 点击此处 免费索取本论文简介和目录>>
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论文摘要: 柑橘属于一种亚热带经济果木,是世界上种植面积最为广‘泛的果树之一.然而,柑橘的种(略)遭受低温伤害,每年经济损失巨大并随着全球气候变化多端呈现上升趋势.而枳,作为柑橘属近缘植物,在经历冷驯化后能够耐受-20℃的低温侵袭.研究柑橘不同品种抗寒性能的差异和探讨低温驯化的分子机制已成为柑橘抗逆领域的研究热点,尤其是在常规育种方法不足以显著改变植株耐寒性的情况下.近期,柑橘基因(略)完成将极大(略)基因及抗逆分子机制的研究.因此获取更多低温胁迫下的柑橘的基因和生物学信息,对柑橘分子抗寒机理的研究和今后的生产实践具有深远的意义. 在实验室前期柑橘研究的基础上,本研究以枳为实验材料,对其进行模拟自然条件下入冬时期温度变化处理,利用抑制性消减杂交技术构建枳低(略)及反向cDNA文库,获取特异表达的EST序列,生物信息学分析预测其同源序列基因的功能,并对EST序列的功能进行分类注释和功能比对分析.对获得BLAST比对结果的35条ESTs分析结果表明,枳的低温驯化过程中差异表达基因(略)谢、防御、信号传导、表达调控、光合作用、蛋白合成各方面,成功获取了一些具有潜在价值的EST序列.本研究一方...
Citrus is a subtropical fruit tree which has b(omitted) cultivated around the world. However, the plantation of citrus frequently suffers from low-temperature stress, and so the economic loss w(omitted)d will continue at an ever increasing pace with the climate change. Yet Poncirus (omitted) (L.) Raf., an interfertile citrus relative, is extremely cold tolerant and can survive fre(omitted)℃if fully co(omitted)ted. To investigate the differences and molecular mechanism of cold acclimation has been a maj...
目录:
摘要第4-5页
Abstract第5页
第1章 文献综述第8-18页
  ·植物响应低温胁迫研究现状第8-13页
    ·低温胁迫下植物的生理生化研究第8-9页
    ·低温胁迫的信号转导机制研究第9-10页
    ·低温胁迫的转录调控机理研究第10-12页
    ·低温胁迫的蛋白质组学研究第12-13页
  ·差减cDNA文库与SSH技术第13-18页
    ·差减cDNA文库第13-14页
    ·SSH技术第14-18页
第2章 低温胁迫下枳正反向差减cDNA文库的构建第18-37页
  ·前言第18页
  ·材料与方法第18-32页
    ·材料及处理第18-19页
    ·主要仪器与耗材第19页
    ·主要试剂、药品及配制方法第19-20页
    ·实验方法第20-32页
  ·结果与分析第32-35页
    ·总RNA的抽提与质量检测第32-33页
    ·mRNA分离纯化结果第33页
    ·cDNA的合成及其RsaⅠ酶切结果第33-34页
    ·Tester接头连接效率分析第34页
    ·差减效率检测第34-35页
    ·阳性克隆检测第35页
  ·讨论第35-37页
第3章 差减cDNA文库EST的获取及生物信息学分析第37-42页
  ·前言第37页
  ·材料与方法第37-38页
    ·材料第37页
    ·生物信息学分析软件及数据库第37页
    ·实验方法第37-38页
  ·结果与分析第38-40页
    ·测序结果统计分析第38页
    ·EST序列功能比对第38-40页
    ·EST序列预测功能的分类注释和分析第40页
  ·讨论第40-42页
第4章 结论与创新第42-43页
  ·结论第42页
  ·创新点第42-43页
参考文献第43-49页
致谢第49-50页
作者简介第50页
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