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活体生物计算模型在NP-完全问题中的应用
中文名称: 活体生物计算模型在NP-完全问题中的应用
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论文编号: 4140811收藏本论文】【我的收藏】【我要投稿
英文名称: 无英文名称
学位类型: 硕士毕业论文
作者: 涉及隐私,隐去***  作者本人请参看权力声明>>
导师: 涉及隐私,隐去***
毕业学校: 涉及隐私,隐去***
专业: 生物物理学
毕业年份: 涉及隐私,隐去***
关键字: 活体生物计算 质粒DNA Hamilton路问题 电场分离装置 SAT问题
简介目录: 点击此处 免费索取本论文简介和目录>>
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论文摘要: 自上世纪九十年代Adleman在实验室用分子生物实验操作成功地求解一(略)Hamilton路问题以来,生物计算这个全新的研究领域就随之产生.因为生物计算具有巨大的并行性、海量的存储能力以及较低能耗等优势,该领域的(略)起众多研究者的关注.本文结合分子生物学的实验技术及研究方法,对生物计算及其计算模型的生物实现做了初步的分析及讨论,并主要从活体生物计算模型出发,对图与组合优化中的哈密尔顿路(HPP)和可满足性(SAT)两个基本问题进行了讨论与研究,具体内容如下: 目前生物计算中存在三个难点问题:1、编码,把求解的问题映射为生物分子,这也是生物计算中首要解(略)前的编码方法还不能很好地满足生物计算模型的实际需求;2、生物实现,(略)和操作,使得代表问题解的分子顺利生成,而不出现“伪解”或“错解”;3、解的检测,如何止确检测问题的解是当前生物计算研究中的困难问题之一,本文对现有检测(略)细的论述和分析. 活体生物计算模型是基于各种生化分子在生物活体内以特定形式进行的相互协作处理信息而出现的一种新的生物计算模型.由于它的计算组成部件具有一定的计算能力,并且直接镶嵌在生物活体里...
A bran-new research field biological computation came forth since Adleman implemented the mol(omitted)logical experi(omitted)lve the problem of Hamilton Path in the nineties of the last century. With the advantages of huge parallelism,(omitted)torage capability and lower energy cost, biological compu(omitted)drawing more and more attention of researchers. This paper gives a preliminary analysis a(omitted)ion about the biological realization of biological computation and its algorithmic models under the...
目录:
摘要第3-5页
Abstract第5-6页
第1章 绪论第9-17页
  ·生物计算研究的背景与意义第9-10页
  ·生物计算的原理第10-11页
  ·生物计算的研究现状第11-16页
    ·生物计算的研究现状第11-13页
    ·现有生物计算模型介绍第13-16页
  ·本文的内容安排第16-17页
第2章 生物计算基本知识第17-31页
  ·生物计算中的分子结构第17-20页
    ·DNA分子的结构第17-18页
    ·RNA分子的结构第18-19页
    ·PNA分子的结构第19-20页
    ·纳米金颗粒第20页
  ·基本的生物操作第20-31页
    ·生物分子的合成:合成所需长度的分子串第21-22页
    ·分子杂交:两个互补的单串杂交形成双链第22-24页
    ·熔解(变性):双链DNA解聚形成单串第24-25页
    ·扩增:DNA串的多重复制第25页
    ·切割:利用限制性切割酶在特定的位点将DNA双链切割第25页
    ·连接:利用连接酶将两个DNA链连接起来第25-27页
    ·检测:检测或读出结果数据池中的解序列第27-30页
    ·其他生物操作第30-31页
第3章 活体生物计算模型在Hamilton路问题上的应用第31-42页
  ·引言第31-32页
  ·质粒DNA分子的基本结构与操作第32-33页
  ·问题描述第33-34页
  ·活体生物计算模型在Hamilton路问题中的应用第34-37页
    ·质粒DNA的构建第34-35页
    ·算法描述第35-37页
  ·举例说明算法实现第37-41页
  ·算法分析与讨论第41-42页
第4章 基于活体生物计算模型求解SAT问题的分子算法第42-54页
  ·引言第42-43页
  ·活体生物计算模型第43-45页
  ·问题描述第45-46页
  ·活体生物计算模型在SAT问题中的应用第46-48页
  ·应用举例第48-52页
  ·算法推广第52-53页
  ·算法分析与讨论第53-54页
第5章 全文总结与进一步研究工作第54-57页
  ·全文总结第54-55页
  ·进一步研究工作第55-57页
参考文献第57-63页
致谢第63-64页
攻读硕士学位期间的研究成果第64页
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