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核酸与蛋白质相互作用的AFM单分子力谱研究
中文名称: 核酸与蛋白质相互作用的AFM单分子力谱研究
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论文编号: 4140155收藏本论文】【我的收藏】【我要投稿
英文名称: The Investigation of Nucleic Acid-Protein Interactions Using AFM-based Single Molecule Force Spectroscopy
学位类型: 博士毕业论文
作者: 涉及隐私,隐去***  作者本人请参看权力声明>>
导师: 涉及隐私,隐去***
毕业学校: 涉及隐私,隐去***
专业: 高分子化学与物理
毕业年份: 涉及隐私,隐去***
关键字: DNA构象 单分子力谱 核酸与蛋白质的相互作用 烟草花叶病毒 动态力学谱
简介目录: 点击此处 免费索取本论文简介和目录>>
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论文摘要: 核酸与蛋白质是组成生命的主要生物大分子,二者的相互作用构成了诸如生长、繁殖、遗传和代谢等生命现象的基础.从单分子水平上对它们的相互作用进行(略)利于人们更加深入地理解与调控这些重要的生理过程,是人们解开生命奥秘的关键所在.基于原子力显微镜的单分子力谱技术是一种非常有效的研究分子间/分子内相互作用的方法.本论文首(略)谱的原理和它在生物学领域的应用进行了总结,然后通过对两个核酸-蛋白质体系的研究利用并发展了该力谱方法.这两个核酸-蛋白质体系分别为:⒈长链双螺旋DNA与SSB蛋白⒉烟草花叶病毒中基因组RNA与衣壳蛋白(略)用.本论文的工作围绕以上两个体系并遵从由简入繁的原则展开: 一、研究了双螺旋DNA在外力诱导下构象转变的本质以及单股DNA与(略)相互作用.以长链双螺旋DNA作为探针,利用单分子力谱的方法并结合单股DNA结合蛋白(SSB)只与单股DNA结合而不与双螺旋DNA结合的特性,研究了双螺旋DNA在较低外力(65 pN左右)诱导下构象转变的本质. (略)复杂的完整烟草花叶病毒(TMV)为模型体系,研究基因组RNA与衣壳蛋白之间的相互作用.我们首次将RNA从T...
Nucleic acids and proteins are two important biomacromolecules that compo(omitted)e, and the inte(omitted)etween them are the base of many biological phenomena, such as growth, propagation, inheritance, metabolism, and so on. The nano-mechanical de(omitted) nucleic acid-protein interactions at single-molecule level will deepen our understanding(omitted)ually gain controls on these biological processes. This is also the key to explore the mysteries of life. Atomic force mi(omitted)AFM)-based single mole...
目录:
提要第5-7页
Abstract第7-9页
第1章 前言第13-45页
  ·基于原子力显微镜技术的单分子力谱第13-21页
    ·单分子力谱仪的原理第13-15页
    ·测量过程及力谱的获得第15-18页
    ·单链拉伸实验及判断标准第18-20页
      ·单链拉伸的实验第18-19页
      ·单链拉伸的判断标准第19-20页
    ·动态力学谱第20-21页
  ·单分子力谱在生物领域中的应用第21-38页
    ·DNA分子的拉伸与操纵第22-27页
      ·长链DNA拉伸的力学指纹谱第22-23页
      ·以长链DNA为探针研究DNA与DNA结合分子的相互作用第23-25页
        ·DNA-DNA结合药物分子的相互作用第23页
        ·DNA-DNA结合蛋白的相互作用第23-25页
      ·DNA齐聚物的拉伸与操纵第25-26页
      ·以DNA齐聚物为探针研究DNA与蛋白质的相互作用第26-27页
    ·蛋白质折叠结构的打开第27-29页
    ·多糖分子的构象转变第29-32页
    ·配体-受体识别作用第32-38页
      ·几种模型体系的体外研究第32-34页
      ·细胞和细菌体系的探测第34-38页
  ·本论文的研究思路第38-39页
  参考文献第39-45页
第2章 在外力诱导下双链DNA构象转变的本质—单股DNA与SSB蛋白的相互作用第45-63页
  ·引言第45-46页
  ·实验部分第46-49页
    ·样品制备第46-47页
    ·单分子力谱实验第47-49页
  ·实验结果与讨论第49-58页
    ·外力诱导下的双链DNA与SSB蛋白的相互作用第49-50页
    ·拉伸长度、停留时间、盐离子浓度对双链DNA构象转变以及SSB蛋白与单股DNA相互作用的影响第50-55页
    ·解螺旋的双链DNA与SSB蛋白的相互作用第55-58页
  ·本章小结第58-59页
  参考文献第59-63页
第3章 烟草花叶病毒中RNA与衣壳蛋白之间的相互作用第63-79页
  ·引言第63-64页
  ·实验部分第64-66页
    ·样品制备第64-65页
    ·单分子力谱实验第65-66页
  ·实验结果与讨论第66-76页
    ·烟草花叶病毒中RNA从蛋白外壳上解组装第66页
    ·验证实验第66-70页
      ·WLC模型拟合与poly A RNA叠加第67页
      ·RNA基因组中相邻AAG序列长度的统计第67-69页
      ·RNA水解酶对比实验第69-70页
    ·影响RNA解组装力大小的因素第70-73页
      ·溶液pH值对TMV中RNA与衣壳蛋白之间相互作用的影响第70-71页
      ·拉伸速率对TMV中RNA与衣壳蛋白之间相互作用的影响第71页
      ·EDTA可以削弱TMV管口处RNA与衣壳蛋白之间的相互作第71页
      用第71-73页
    ·RNA的重新组装第73-76页
  ·本章小结第76-77页
  参考文献第77-79页
第4章 烟草花叶病毒中RNA与衣壳蛋白解离的动力学研究第79-95页
  ·引言第79-80页
  ·实验部分第80-81页
    ·样品制备第80页
    ·单分子力谱实验第80-81页
  ·实验结果与讨论第81-91页
    ·在pH值为4.7和7.0条件下RNA与衣壳蛋白断裂力的加载速率依赖性第81-86页
    ·动力学参数的计算第86-87页
    ·在pH值为4.7和7.0条件下RNA与衣壳蛋白解离的机制第87-91页
  ·本章小结第91-92页
  参考文献第92-95页
作者简历第95页
博士期间发表的论文第95-96页
博士期间参加的学术会议第96-97页
致谢第97页
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