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蝗总科部分种类COⅡ和18SrDNA基因分子系统学研究
中文名称: 蝗总科部分种类COⅡ和18SrDNA基因分子系统学研究
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论文编号: 4137192收藏本论文】【我的收藏】【我要投稿
英文名称: 无英文名称
学位类型: 硕士毕业论文
作者: 涉及隐私,隐去***  作者本人请参看权力声明>>
导师: 涉及隐私,隐去***
毕业学校: 涉及隐私,隐去***
专业: 生物化学与分子生物学
毕业年份: 涉及隐私,隐去***
关键字: 蝗总科 COⅡ 18SrDNA 系统发育
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论文摘要: 蝗总科是直翅目蝗亚目的一个大类群,全世界有超过一万种.分布于全世界的热带、温带的草地和沙漠地区.郑哲(略))整理我国蝗总科共计有8科253属1053种.近几年又不断的有新种发表.本研究对蝗总科部分种类的线粒体基因COII与核基因18SrDNA进行联合分析,重建了其系统发育关系,为蝗总科的系统发育研究提供分子依据. 本研究共提取了蝗(略)属24种蝗虫的总DNA.用一对引物扩增出长为684bp的COII基因全序列24条;用2对引物扩增出长为1803bp的18SrDNA基因(略)条.以蟋蟀总科Acheta domesticus、蚤蝼总科Ellipes minuta的COII和18SrDNA序列(从genebank中下载)作为外群进行系统发育分析.其分析过程包括:ClustalX-(略)A序列进行比对;MEGA5.2对序列的碱基组成、碱基替换、遗传距离分析、碱基替换饱和分(略)P4.0b10中对序列进行g1及PTP检验,对获得的序列进行系统发育信号检测;用PAUP4.0b10及MrBayes重建蝗总科4科部分种类的系统发育关系,最终得出以下结果: 1.蝗总科24种昆虫线粒体基...
Acridoidea is a big superfamily in Caelifera of Orthoptera.There were about ten tho(omitted)cies of Acridoidea in the worldwide,most of them distributed in tropical,temperate(omitted)esert region.In china,there were about 8 family253 genus 1053species of Acrido(omitted)ding to the arrangement o(omitted)03),in recent year,several species have been published.In this paper,we are study COII and 18SrDNA gene sequence of partial species of Acridoidea and reconstruct the phylogenetie relati(omitted) provide ...
目录:
摘要第3-5页
Abstract第5-6页
第一部分 前言第9-16页
  ·蝗总科简介及分类研究现状第9-11页
    ·蝗总科昆虫简介第9页
    ·蝗总科分类研究概况第9-10页
    ·蝗总科分子系统学研究概况第10-11页
  ·昆虫分子系统学第11-13页
    ·分子系统学定义第11页
    ·分子系统学研究方法第11-12页
    ·分子系统树构建方法第12-13页
  ·线粒体基因组及COII基因第13-14页
    ·线粒体基因组成及发育分析优势第13页
    ·线粒体基因在分子系统学中的应用第13-14页
    ·COII基因及COII在分子系统学中的应用第14页
  ·核基因及18SrDNA在动物分子系统学中的应用进展第14-15页
    ·核基因应用简介第14-15页
    ·SrDNA的特点及其应用第15页
  ·本研究的目的和意义第15-16页
第二部分 材料和方法第16-24页
  ·实验材料第16-19页
    ·实验标本的采集、保存与鉴定第16页
    ·实验仪器和试剂第16-19页
  ·实验方法第19-22页
    ·总DNA提取第19-21页
    ·PCR扩增第21-22页
  ·实验数据处理和分析第22-24页
    ·序列校对与同源性比较第22页
    ·序列比对第22页
    ·序列组成分析第22页
    ·数据组系统发育信号检验第22-23页
    ·系统发育树的构建第23页
    ·进化树的统计检验第23-24页
第三部分 结果分析第24-59页
  ·基因组总DNA的提取、PCR扩增及序列的测定第24页
    ·基因组总DNA提取第24页
    ·PCR产物检测第24页
    ·PCR产物的测序第24页
  ·COII基因序列分析结果第24-28页
    ·COII基因序列组成分析第24-25页
    ·COII基因碱基替换分析第25-26页
    ·氨基酸组成和密码子的使用第26页
    ·不同种间COII基因遗传距离分析第26页
    ·系统发育信号检测第26-28页
  ·SrDNA基因序列分析结果第28-31页
    ·SrDNA基因序列组成分析第28页
    ·SrDNA基因碱基替换分析第28-29页
    ·不同种间18S rDNA基因遗传距离分析第29页
    ·系统发育信号检测第29-31页
  ·联合基因序列分析结果第31-41页
    ·联合基因序列组成分析第31页
    ·联合基因碱基替换分析第31-32页
    ·不同种间联合基因遗传距离分析第32页
    ·系统发育信号检测第32-41页
  ·构建系统发育树第41-59页
    ·最大似然法建树第41-45页
    ·贝叶斯法建树第45-50页
    ·简约法建树第50-54页
    ·邻接法建树第54-58页
    ·不同方法构建的系统树的比较第58-59页
第四部分 结论第59-61页
参考文献第61-68页
致谢第68-69页
攻读学位期间研究成果第69页
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