免费论文
收费论文
发表论文
我要投稿
设为首页 招标网
联系我们
经济学|管理学|法学|计算机|医学|教育|文学|政治|艺术|哲学|更多 经济学|管理学|法律|计算机|医学|教育|文学|政治|艺术|哲学|更多
 论文搜索
  推荐服务: 论文发表 收费论文
期刊论文格式
毕业论文格式
期刊论文范文
毕业论文范文
论文致谢
毕业论文答辩
开题报告
论文选题
英文摘要书写
基于个体和群体DNA数据的单体型频率估计
中文名称: 基于个体和群体DNA数据的单体型频率估计
全文提供: 购买充值卡,就可下载本篇论文全文  
论文编号: 4123674收藏本论文】【我的收藏】【我要投稿
英文名称: Fast and Accurate Algorithm for Haplotype Estimation from Individual and Pooling DNA Data
学位类型: 硕士毕业论文
作者: 涉及隐私,隐去***  作者本人请参看权力声明>>
导师: 涉及隐私,隐去***
毕业学校: 涉及隐私,隐去***
专业: 概率统计
毕业年份: 涉及隐私,隐去***
关键字: Pooling 单体型 压缩感知 CSPool
简介目录: 点击此处 免费索取本论文简介和目录>>
全文提供: 购买充值卡,就可下载本篇论文全文  

       论文发表:快速、低价、包过!发表论文就找论文天下

论文摘要: 基因研究中一个重要的课题是从基因型数据中推断出单体型对的形式,这就涉及了估计单体型的频率.本文针对个体型和群体型DNA数据给出了一个统一的算法CSPool对单体(略)估计.特别地,对个体型数据而言,针对每个个体的基因型CSPool可以推断其一对单体型的相形.相较以往的方法而言,本文使用的方法有较大的速度优势,(略)集和数据类型中与多种方法有可比的准确性,拥有较小的偏差和同其他方法可比的解的稳定性.此外,本文率先在单体型频率估计中引入压缩感知作为工具,对稀疏性先验进行充分利用,从而达到快速且准确的对单体型频率进行估计并推断基因的相形;本文亦提出了处理位点(略)与压缩感知相应的分割捆绑算(略),从而可以估计位点比较多的单体型.亦实现了CSPool的图形界面和网页应用软件.在不同类型的数据集上,本文使用了CSPool与一些现有方法进行了比较,发现CSPool具有一定的优越性.基于此,可以预见,本文提出的方法CSPool在现在下一代测序技术大发展的背景下有很大的使用空间.
Anessentialproblemingeneticanalysisisinferringhaplotypepairsfromunphasedgenot(omitted)nthispaper, amethodisproposedanovelalgorithmCSPooltoestimatehaplotype frequencies an(omitted)nstruct diplotype for each individual from individ-ual genotype. (omitted)better than or comparable with former algorithms in terms ofaccuracy and robustness of esti(omitted)lotype frequencies for various sample siz(omitted)solve the problem in a much faster way. Besides, compressed sensing is firstlysuggested by CSPool to est...
目录:
摘要第4-5页
ABSTRACT第5页
表格第8-9页
插图第9-10页
主要符号对照表第10-11页
第1章 绪论第11-23页
  ·生物背景及一些基本概念第12-14页
    ·单核苷酸多态性第12-13页
    ·单体型第13-14页
  ·Statistic Genetics 中的一些概念第14-23页
    ·Hardy-Weinberg 平衡定律第14-15页
    ·HWD第15-16页
    ·欠定系统和正则化方法第16页
    ·稀疏性第16-17页
    ·压缩感知方法第17-23页
第2章 主要方法第23-31页
  ·HWE 下的CSPool 算法第23-26页
    ·ω的另一种估计方式第25-26页
    ·Haplotype 设计矩阵的性质研究第26页
  ·HWD 下的CSPool 算法第26-28页
  ·基于个体基因型重建单体型第28页
  ·基于CSPool 算法的捆绑分割算法第28-31页
第3章 结果第31-36页
  ·应用于个体数据的结果第31-33页
    ·参数∈的选择第33页
  ·应用于Pool 数据的结果第33-34页
    ·T 和N 值小的情况第33-34页
  ·应用程序第34-36页
    ·图形界面第34页
    ·网页服务器第34-36页
第4章 表格第36-43页
参考文献第43-46页
致谢第46-47页
在读期间发表的学术论文与取得的研究成果第47页
本类相关论文:
·基于互信息频度的特征选择及其在SNP关联分析中
·中国藏族人群CYP2D6基因多态性分析研究
·DDC基因和DRD4基因多态性与人类认知能力的
·不同海拔三个藏族人群HIF-1α基因与HIF-
·一个CIN伴听觉障碍家系致病基因的定位及突变分
·一个结节性硬化症家系的分子遗传学分析
·一先天性白内障家系的分子遗传学分析
·人类复杂疾病基因编码区碱基突变特征分析
·人类心脏发育候选基因PYGO1的克隆与功能研究
·人类新基因ZNF307的功能研究
单体型论文 压缩感知论文
·炎性体信号通路相关microRNA多态性和NE
·基于分块的单体型推导算法及缺失问题研究
·HBS1L-MYB基因、BCL11A基因和HB
·DNA修复基因XRCC1、XPD单核苷酸多态性
·不适定问题高效算法研究
·单倍型的分布估计和关联分析
·基于空间谱理论和时空两维随机辐射场的雷达成像研
·压缩感知理论及在成像中的应用
   免费论文
公共管理 | 法学 | 理学 | 医药学
政治 | 社会学 | 文学 | 艺术 | 哲学
工学 | 计算机 | 文化 | 英语论文
经济学 | 财政 税收 | 证券金融
管理学 | 会计审计 | 工商管理 | 教育
财务管理 | 论文写作指导 | 应用文
   收费论文
马列毛邓 | 哲学宗教 | 社会科学
政治法律 | 军 事 | 经 济
文化科学教育体育 | 语言文字
文学 | 艺术 | 历史地理 | 自然科学
数理化 | 天文 | 生物科学 | 医药卫生
农业科学 | 工业技术 | 交通运输
航空航天 | 环境安全
   浏览历史

联系论文网 | 收费论文 | 发表论文 | 论文翻译 | 友情链接 | 全部分类 | 网站地图 | 期刊导航
版权所有 2008-2018 论文天下 www.lunwentianxia.com 京ICP备08104503号