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Pseudomonas sp. WBC-3菌株分解代谢4-硝基酚的机理研究
中文名称: Pseudomonas sp. WBC-3菌株分解代谢4-硝基酚的机理研究
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论文编号: 3101177收藏本论文】【我的收藏】【我要投稿
英文名称: Molecular Characterization of Catabolism of 4-Nitrophenol in Pseudomonas sp. WBC-3
学位类型: 博士毕业论文
作者: 涉及隐私,隐去***  作者本人请参看权力声明>>
导师: 涉及隐私,隐去***
毕业学校: 涉及隐私,隐去***
专业: 微生物学
毕业年份: 涉及隐私,隐去***
关键字: Pseudomonas sp. WBC-3 4-硝基酚 代谢途径 4-硝基酚单加氧酶 趋化 质粒基因组分析
简介目录: 点击此处 免费索取本论文简介和目录>>
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论文摘要: 硝基芳香烃化合物是重要的化工原料,常(略)料、农药等合成的前体.这类化合物能在环境中长期残留,已经对土壤、水体和大气造成了严重的污染.硝基芳香烃化合物能影响人体的物质代谢,有致癌、致畸和致突变等危险,严重威胁着人类的健康和生存.苯环结构的对称性和稳定性使硝基芳香烃化合物不易(略),而环境中的许多微生物却能够利用这些污染物作为唯一的碳源、氮源和能源来生长,能把这些污染物完全降解.微生物的这一特性使其在污染物的生物治理和生物修复中(略)的优势,因而越来越受到人们的青睐.同时,对这些微生物的代谢途径和代谢基因的研究也成为本领域研究的热点. 本论文的研究工作分为以下三个部分. (略)是Pseudomonas sp.WBC-3对4-硝基酚的代谢途径研究. WBC-3是一株能够利用甲基对硫磷(Methyl Parathion,MP)和4-硝基酚(4-Nitrophenol,4-NP or PNP)做为唯一碳源、氮源及(略)兰氏阴性菌.WBC-3降解MP的第一步是在甲基对硫磷水解酶(Methyl parathionhydrolase,MPH)的作用下生成4-硝基酚...
Nitroaromatic compounds are common starting materials for(omitted)esis ofcomplex industrial N-containing compounds(omitted)e major environmentalcontaminants, hazardous metabolic intermediates or dead-end products.(omitted)isms play an important role in transforming these recalcitrantcontaminants and in the associated recycling of the nitrogen. In the pastdecades, the intensive research(omitted)rea has led to dramatic progress inunderstanding the microbial strategies and associated m(omitted)for t...
目录:
摘要第3-6页
Abstract第6-9页
第1章 引言——硝基芳香烃化合物的微生物代谢途径及机理研究第16-35页
  ·硝基苯(Nitrobenzene)的代谢途径第18-20页
    ·部分还原途径第19页
    ·双加氧途径第19页
    ·硝基苯下游代谢途径比较第19-20页
  ·硝基苯甲酸(nitrobenzoates,NBA)的代谢途径第20-22页
    ·-硝基苯甲酸的代谢途径第20页
    ·-硝基苯甲酸的代谢途径第20-22页
    ·-硝基苯甲酸的代谢途径第22页
  ·硝基甲苯(Nitrotoluene)的代谢途径第22-27页
    ·-硝基甲苯的代谢途径第22-23页
    ·-硝基甲苯的代谢途径第23页
    ·-硝基甲苯的代谢途径第23-24页
    ·,4-二硝基甲苯(2,4-dinitrotoluene,2,4-DNT)的代谢途径第24页
    ·,6-二硝基甲苯(2,6-dinitrotoluene,2,6-DNT)的代谢途径第24-25页
    ·三硝基甲苯(2,4,6-trinitrotolene,TNT)的代谢途径第25-27页
  ·硝基酚(Nitrophenol,NP)的代谢途径第27-31页
    ·-硝基酚的代谢途径第28页
    ·-硝基酚的代谢途径第28页
    ·,4,6-三硝基酚(2,4,6-trinitrophenol,TNP)的代谢途径第28-29页
    ·二硝基酚(Dinitrophenol,DNP)的代谢第29-30页
    ·有机磷农药的微生物降解第30-31页
  ·芳香烃化合物代谢途径研究的趋向第31-32页
  ·-硝基酚(4-Nitrophenol,4-NP or PNP)的代谢途径研究进展第32-34页
    ·-硝基酚的代谢途径第32-34页
    ·-硝基酚代谢途径的分子生物学研究第34页
  ·本研究目的和意义第34-35页
第2章 材料和方法第35-41页
  ·培养基第35页
  ·菌株及其培养方法第35页
  ·工具酶和试剂第35页
  ·分子生物学实验方法第35-38页
    ·常规分子生物学方法第35页
    ·染色体DNA制备第35页
    ·基因组步移(Genomic walking)第35-36页
    ·Pseudomonas sp.WBC-3菌中的基因敲除第36-38页
  ·酶活测定(Enzyme Assay,cell free assay)第38-39页
  ·生物转化(Biotransformation,resting cell assay)第39页
  ·分析方法第39页
    ·HPLC检测第39页
    ·蛋白浓度测定第39页
    ·亚硝酸根的测定第39页
  ·趋化试验第39-40页
  ·DNA序列测定及分析第40页
  ·WBC-3的质粒pZWL0的全基因组序列测定及分析第40-41页
第3章 Pseudomonas sp.WBC-3菌株分解代谢4-硝基酚的代谢途径及代谢机理研究第41-61页
  ·WBC-3菌株降解4-硝基酚的代谢途径研究第41-44页
    ·WBC-3菌株4-硝基酚单加氧酶的酶活测定第41-42页
    ·WBC-3菌株对苯二酚双加氧酶的酶活测定第42-44页
  ·对苯二醌还原酶基因的克隆第44页
  ·基因组步移法克隆4-硝基酚代谢基因簇第44页
  ·-硝基酚代谢基因簇的生物信息学分析第44-49页
  ·-硝基酚单加氧酶的功能验证及酶学特性研究第49-51页
    ·pnpA在E.coli中的表达第49页
    ·生物转化法测定PnpA的活性第49-50页
    ·-硝基酚单加氧酶的酶活测定第50页
    ·-硝基酚单加氧酶的酶学特性研究第50-51页
      ·辅因子对4-硝基酚单加氧酶酶活的影响第50页
      ·-硝基酚单加氧酶氧化4-硝基酚和NADPH的比例第50-51页
      ·-硝基酚单加氧酶的底物范围测定第51页
      ·-硝基酚单加氧酶对4-硝基酚和4-硝基邻苯二酚的比活测定第51页
  ·对苯二酚双加氧酶的功能验证第51-52页
  ·基因敲除验证 4-硝基酚代谢关键酶基因第52-53页
  ·讨论第53-61页
    ·-硝基酚单加氧酶属于典型的黄素蛋白单加氧酶家族第53-55页
    ·对苯二醌还原酶基因在 4-硝基酚代谢途径中的作用第55-56页
    ·对苯二酚双加氧酶的酶学特点第56-58页
    ·WBC-3菌株中 4-硝基酚代谢操纵子的研究第58-59页
    ·-硝基酚两种代谢途径的比较第59-61页
第4章 Pseudomonas sp.WBC-3的趋化特性研究第61-76页
  ·引言——微生物的趋化机理及其在环境污染物降解中的作用第61-69页
    ·微生物趋化的概念第61页
    ·微生物趋化的机理第61-62页
    ·趋化与微生物代谢的关系第62-63页
    ·细菌对简单芳香烃的趋化第63-64页
    ·细菌对萘的趋化研究第64-65页
    ·细菌对硝基芳香烃化合物的趋化第65页
    ·趋化在微生物降解有机污染物中的作用第65-68页
    ·本研究的目的及意义第68-69页
  ·实验结果第69-71页
    ·Pseudomonas sp.WBC-3对其可代谢芳香烃化合物的趋化第69页
    ·Pseudomonas sp.WBC-3对其非代谢芳香烃化合物的趋化第69-70页
    ·Pseudomonas sp.WBC-3代谢突变株的趋化特性第70-71页
    ·Pseudomonas sp.WBC-3对甲基对硫磷的趋化第71页
  ·讨论第71-76页
    ·WBC-3对芳香烃化合物的趋化是不依赖于代谢的趋化第71页
    ·WBC-3对芳香烃化合物的趋化属于β-ketoadipate控制的趋化系统第71-72页
    ·β-ketoadipate趋化系统在土壤微生物中广泛存在第72-73页
    ·微生物对芳香烃化合物趋化机制的研究进展第73-74页
    ·WBC-3对甲基对硫磷的趋化第74页
    ·趋化研究方法的进展第74-76页
第5章 Pseudomonas sp.WBC-3 甲基对硫磷降解性质粒pZWL0的全序列分析第76-89页
  ·WBC-3质粒pZWL0的全序列测定及分析第77页
  ·甲基对硫磷水解酶基因(mph)定位在转座子上第77-83页
    ·转座子的分类及结构特点第77-83页
    ·mph转座子的结构特点.第83页
  ·有机磷水解酶的起源和进化第83-86页
    ·有机磷水解酶的分类第83页
    ·有机磷水解酶的转座子定位第83-84页
    ·有机磷水解酶的进化分析第84-85页
    ·有机磷水解酶的起源与进化历程第85-86页
  ·WBC-3质粒pZWL0中与质粒复制、传代有关的基因第86-87页
  ·WBC-3质粒pZWL0中与质粒接合转移相关的基因第87页
  ·WBC-3质粒pZWL0中的其它功能未知基因第87页
  ·WBC-3质粒pZWL0的基因组织结构特点第87-88页
  ·结论第88-89页
第6章 结论和进一步工作设想第89-91页
  ·结论第89-90页
    ·Pseudomonas sp.WBC-3中4-硝基酚的代谢途径研究第89页
    ·Pseudomonas sp.WBC-3的趋化特性研究第89-90页
    ·Pseudomonas sp.WBC-3的质粒pZWL0序列分析第90页
  ·进一步工作设想第90-91页
参考文献第91-105页
发表与待发表文章目录第105-106页
致谢第106页
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