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三种沼虾的COI基因序列变异及其分类地位探讨

动物学研究200930(6):613-619 ISSN: 0254-5853N:

三种沼虾的I基因序列变异及其分类地位探讨
张凊漪 1,程起群 2, * ,管卫兵 1
1. 上海市教委大洋生物资源开发和利用重点实验室,上海海洋大学 海洋科学学院,上海 201306;
2. 农业部海洋与河口渔业资源及生态重点开放实验室,中国水产科学研究院东海水产研究所,上海 200090
收稿日期 2009-5-19 修回日期 网络版发布日期 2009-12-20 接受日期 2009-10-9
摘要 罗氏沼虾(arbrahiu rsenbergii)和日本沼虾(. nippnense)已经在我国得到广泛的养殖,产生巨大的经济效益。祁连沼虾(. qilianensis)是自然分布在我国甘肃省的土著虾种,因其外部形态符合沼虾属的特征,而被前人归入沼虾属。为了从分子生物学的角度理解罗氏沼虾、日本沼虾与祁连沼虾的遗传差异,为合理开发和利用沼虾资源提供理论基础,作者对这3种沼虾的线粒体I基因序列进行研究。从甘肃、浙江等地分别采集这三种沼虾的样本各10尾,共30尾,其中祁连沼虾是野生样本,而罗氏沼虾和日本沼虾都是养殖样本。通过PR方法扩增线粒体I基因,并测序。通过比对,获得一致序列649 bp。在30个样本中共检测到169个变异位点,占总变异的26.04%;共检测到7种单倍型。 3种沼虾的核苷酸多态性分别为:罗氏沼虾0.411%、日本沼虾0.092%、祁连沼虾0.031%。野生的祁连沼虾遗传多样性远远低于养殖的罗氏沼虾和日本沼虾。三种沼虾单倍型之间的Kiura双参数遗传距离在19.87%~23.84%,三者之间的遗传距离较大,提示三者均为有效种。为进一步确定这三种沼虾在长臂虾科的分类地位, 我们从NBI数据库中下载了长臂虾科的其它种类的I序列进行系统发生分析。用NJ法构建的分子系统树显示:日本沼虾和罗氏沼虾与沼虾属的其它种类聚成一枝,而祁连沼虾与同亚科的脊尾白虾(Expalaen ariniauda)和长角长臂虾(Palaen debilis)较沼虾属另10种虾的遗传距离近,即祁连沼虾与白虾属及长臂虾属聚成另一枝。因此,I序列的结果不支持祁连沼虾归入沼虾属。但其分类地位应该综合多方面证据重新进行分析确定。

关键词

FNT-FAILY: 'Ties Ne Ran' s-fnt-kerning: 1.0pt s-ansi-language: EN-US s-fareast-language: ZH-N s-bidi-language: AR-SA 沼虾; 遗传差异; 分类; I基因; 线粒体DNA

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分类号
DI: 10.3724/SP.J.1141.2009.06613
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三种沼虾的COI基因序列变异及其分类地位探讨

动物学研究200930(6):613-619 ISSN: 0254-5853N: 三种沼虾的 I 基因序列变异及其分类地位探讨 张凊漪 1 ,程起群 2, * ,管卫兵 1 1. 上海市教委大洋生物资源开发和利用重点实验室,上海海洋大学 海洋科学学院,上海 201306; 2. 农业部海洋与河口渔业资源及
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